一口馬主を始めた初心者が最も衝撃を受けるのが、購入後にかかり続けるランニングコストの重さです。競走馬の購入代金（出資金）はあくまで入場券に過ぎません。
出資確定後、2歳の育成段階から現役引退に至るまで、毎月「維持費・預託料」が口数に応じて請求されます。美浦や栗東のトレーニングセンターに入厩している期間は、競走馬1頭につき月額60万〜75万円前後の預託料が発生します。これを例えば40口クラブであれば1口あたり月額約1万5,000円〜1万8,000円、500口クラブであれば月額約1,200円〜1,500円を負担します。
さらに見落とされがちなのが、クラブ自体の運営費であるクラブ会費です。どのクラブでも月額3,300円（税込）程度が設定されており、出資頭数が1頭であっても毎月確実に引き落とされます。仮に500口クラブで1頭だけに出資した場合、維持費が月1,500円でもクラブ会費と合算すれば月5,000円弱、年間で約6万円の固定費が愛馬の成績に関わらず流出していきます。デビューが遅れたり、故障で放牧が長引いたりすれば、走ってもいない馬のために数十万円を払い続ける事態に直面します。
