内視鏡鎮静で主流となっている薬剤には、主に「ミダゾラム」と「プロポフォール」の2種類が存在します。それぞれに明確な長所と安全管理上の注意点があります。
ミダゾラム（ベンゾジアゼピン系）：
国内の一般クリニックで最も広く使われている薬剤です。作用が比較的穏やかで健忘効果（検査中の苦痛を忘れる効果）が高いのが特徴です。最大の安全性メリットは、万が一呼吸停止や過鎮静に陥った場合でも、即座に効果を打ち消す拮抗薬（フルマゼニル）が存在する点です。速やかに拮抗薬を静注すれば、数分で覚醒させることができます。
プロポフォール：
導入が極めて早く、検査終了後の覚醒が極めてスピーディーで爽快感があるため、多忙なビジネスパーソンを中心に好まれる薬剤です。しかし、プロポフォールには特異的な拮抗薬が存在しません。呼吸が停止した場合は、薬の血中濃度が自然に低下するまで、医療従事者が気道確保や人工呼吸（アンビューバッグによる換気）で酸素を送り続けなければなりません。そのため、麻酔科医や蘇生技術に習熟した専門医の立ち会いが推奨される、より厳格な管理が求められる薬剤です。
